C'est à l'étage supérieur qu'ont lieu, aujourd'hui encore, les présentations des défunts avant leur inhumation.
Protection fédérale des monuments
L'ossuaire est placé sous la protection fédérale des monuments et a été rénové en douceur entre 1985-1988, selon le principe que diverses modifications ultérieures ont été rétablies dans leur état d'origine.
L'impressionnant mur de crânes est principalement composé d'ossements provenant de l'ancien cimetière, qui était aménagé autour de l'église jusqu'en 1869. Certaines têtes de mort portent le nom de personnes décédées, et plus d'un Natien sait encore aujourd'hui à quel endroit se trouvent les crânes de ses ancêtres. Sur la base de calculs, on suppose qu'il y a environ 31'000 crânes dans l'ossuaire, dont 1'857 sont visibles sur le front. Ce nombre énorme a même surpris les experts.
Protégé contre le vol
Pour lutter contre le vol des crânes, l'ouverture vers le nord a été fermée par des barreaux.
L'inscription "Ce que vous êtes, nous l'avons été / Ce que nous sommes, vous le serez" doit rappeler aux croyants le caractère éphémère de l'existence terrestre.